Обяснено: Как работи тестът за коронавирус (COVID-19).

Как PCR тестът търси вируса в пробите от тампони? Колко време отнема? Колко проби ежедневно тества Индия и може ли да тества повече? Ако може, защо все още не е разширен?

В момента Индия провежда двуетапна PCR в реално време за тестване за SARS-COV-2. (Ройтерс)

Какъв е диагностичният тест за новия коронавирус, който причинява COVID-19?

В Индийският съвет за медицински изследвания (ICMR) обяви определени лаборатории ще използва конвенционалния тест за полимеразна верижна реакция (PCR) в реално време, който се провежда върху тампон, взет от задната част на гърлото, течна проба от долните дихателни пътища или обикновена проба от слюнка. Такива тестове обикновено се използват при откриване на грип A, грип B и H1N1.

Какво представлява PCR тестът?

Той използва техника, която създава копия на сегмент от ДНК. „Полимераза“ се отнася до ензимите, които правят копията на ДНК. „Верижната реакция“ е начинът, по който ДНК фрагментите се копират експоненциално – единият се копира на две, двете се копират в четири и т.н. Кари Мълис, американският биохимик, изобретил PCR техниката, е удостоен с Нобелова награда за химия през 1993 г.

SARS-COV-2 обаче е вирус, направен от РНК, който трябва да бъде превърнат в ДНК. За тази цел техниката включва процес, наречен обратна транскрипция. Ензимът „обратна транскриптаза“ превръща РНК в ДНК. След това се правят копия на ДНК и се амплифицират. Флуоресцентно ДНК свързващо багрило, наречено сонда, показва наличието на вируса. Тестът също така разграничава SARS-COV-2 от другите вируси.

Колко време отнема PCR процесът?

PCR в реално време намалиха времето, необходимо за тестване на пробите, до 4,5 часа от около 6 часа по-рано, каза ученият от ICMR д-р R R Gangakhedkar. Въпреки това, общото време за изпълнение - от момента на събиране на пробите до момента, в който докладът е доставен - е около 24 часа и трябва да бъде по-малко, каза той.

Обяснено: Пет стъпки за откриване на коронавирус

Как се прави тестът в Индия?

В момента Индия провежда двуетапна PCR в реално време за тестване за SARS-COV-2, каза д-р V Рави, старши професор и ръководител на невровирусологията на NIMHANS. Първият етап е предназначен да открие генетични елементи, общи за човешките коронавируси, които може да съществуват в пробата. Вторият етап е предназначен за тестване за специфични гени, присъстващи само във вируса SARS-COV-2.

До началото на март, първоначален скрининг Тест за проверка за всякакъв вид коронавирус беше направен от всички лаборатории, но потвърждаващият PCR беше направен само от Националния институт по вирусология в Пуна. След това NIV Pune прехвърли технологията (реагентите, необходими за потвърждението) във всички лаборатории, така че да няма нужда от проба, която да отиде чак до Пуна. Това намали времето, необходимо за тестване на пробите, каза д-р Рави.

Тестване за коронавирус: Фалшива кръв се вижда в епруветки, етикетирани с коронавирус (COVID-19) в тази илюстрация, направена на 17 март 2020 г. (Илюстрация на Reuters: Dado RuvicO

Индия тества ли достатъчно числа?

Индия има капацитет да тества 10 000 проби дневно и в момента тества около 600-700. За сравнение, Южна Корея, която има подобно време за изпълнение, според съобщенията тества до 20 000 проби на ден, особено използвайки модели като нейните съоръжения за тестване чрез шофиране.

Правителството твърди, че на този етап не е необходимо да се тества всеки човек. Страната тества кохортата, която трябва да тества засега, каза д-р Гангахедкар. Ако използвате локализирано предаване, ние тестваме достатъчно. Ако смятате, че има предаване в общността, това е различен проблем. Все още няма доказателства, където да не знаем как индексният случай е придобил тази инфекция, каза той.

Express Explained вече е в Telegram. Щракнете върху тук, за да се присъедините към нашия канал (@ieexplained) и бъдете в течение с най-новото

Не искаме да правим безразборни тестове, защото сега всички искат тест. Така че някъде ще трябва да го рационализираме... но също така е важно да следим, за да не пропуснем предаването на общността, каза ученият от ICMR д-р Ниведита Гупта по време на брифинг за пресата миналата седмица.

Каква ще бъде стратегията, ако се случи предаване на общността?

ICMR провежда наблюдение за всякакви доказателства за предаване в общността, като всяка от 52-те лаборатории за тестване в Индия тества 20 произволни проби от пациенти с тежка остра респираторна инфекция (SARI). Очаква се „първата част“ на тези тестове да излезе в сряда. ICMR каза, че в случай, че случай на предаване от общността бъде открит от тези тестове за наблюдение, стратегиите на правителството ще бъдат напълно различни.

Пандемия на коронавирус: В болница в Ню Делхи. (PTI снимка/файл)

Има ли пречки пред мащабирането на тестването?

Цената е потенциална бариера, смятат някои експерти. Служители на ICMR казаха на конференция, че цената на първичния тест за COVID-19 е 1500 рупии. Ако трябва да се направи втори тест, за да се потвърдят резултатите от първия, общата цена е около 5000 рупии. Един от служителите каза още, че използваните сонди, които са внесени от Германия, са ограничаващ фактор.

Докато броят на тестовите центрове е увеличен, вносът на сонди също се е увеличил. Миналата седмица Индия искаше да внесе около 200 000 сонди, докато в понеделник д-р Гангахедкар каза, че правителството планира да внесе около милион.

Пандемия на коронавирус: Кога да тестваме и кого

Може ли Индия да прави нещата по различен начин?

Това, което Индия започна да прави, е точно това, което беше препоръчано за страна, в която болестта е внесена, според изпълнителния директор на Института за транслационни здравни науки и технологии в Индия, д-р Гагандип Канг. Въпреки това, тестването и проследяването на тези, които идват в страната, и поставянето под наблюдение на тези, с които са влезли в контакт, е рационален и подходящ подход, ако единственият риск е бил от внасяне на болестта, а проследяването и тестването са били 100 %, тя каза.

Но това, което може да се случи, е, че с тази инфекция можете да се отделите дори преди да развиете симптоми, а в много малко хора може никога да нямате симптоми, така че бихте могли да я предавате на други хора, без да знаете, че сте заразени, каза тя. Този вид сложност... налага да помислите за резервна стратегия, за да видите дали всъщност сте пропуснали нещо, каза тя. Има още, което бихме могли да направим.

Ще помогне ли ICMR наблюдението?

Решението на ICMR е добра стъпка, но има региони, които подобно упражнение тогава би пропуснало, каза д-р Канг. Ако тествате проби всяка седмица от всяка лаборатория за грип, тогава ако откриете дори една положителна, това ще ви каже, че сте пропуснали много, каза тя.

Според д-р Канг е възможно да се използва математическо моделиране, за да се разбере какво би дало на правителството разумен шанс да идентифицира дали вече има някакво предаване от общността. Мисля, че би било чудесно да имаме модела, който има Сингапур, където всеки лекар, който и да е имал клинично подозрение, дори и да не отговаря на описанието, може да изпрати своя пациент за тест, добави тя.

– Приноси от шерифа на Каунаин М

Споделете С Приятелите Си: