Обяснено: Вариант B.1.617 и нарастването на Covid-19 в Индия
Данните за секвениране на генома представиха доказателства за „двойния мутант“ в 61% от пробите в Махаращра. Но дали този нов вариант води до продължаващия скок в Индия, може да се каже само след като бъдат налични повече данни.
Здравните работници подготвят легла в банкетната зала Shehnai в Ню Делхи, която е превърната във временно отделение за пациенти с Covid-9. (Експресна снимка: Амит Мехра) По време на среща с областните лаборатории в Махаращра миналата седмица, Националният институт по вирусология (NIV) сподели ограничени данни, показващи разпадане на 361 геномни секвенирани проби, събрани между януари и март тази година.
Заглавната констатация от Анализът : наличието на двойна мутация е открито в 220 — почти 61 процента — от пробите. Този двоен вариант миналата седмица беше класифициран като вариант B.1.617.
бюлетин| Кликнете, за да получите най-добрите обяснения за деня във входящата си кутия
Какво е B.1.617?
Вариантът B.1.617 на SARS-CoV-2 носи две мутации, E484Q и L452R. И двете се срещат поотделно в много други варианти на коронавирус, но те са докладвани заедно за първи път в Индия.
Двете мутации са открити в шиповия протеин на вируса. Шиповият протеин помага на вируса да се свърже с рецепторите на човешката клетка и да влезе в клетката гостоприемник.
Мутацията E484Q е подобна на E484K, мутация, открита във вариантите на коронавируса в Обединеното кралство (линия B.1.1.7) и Южна Африка (B.1.351).
Мутацията L452R е открита в бързо разпространяващи се варианти в Калифорния (B.1.427 и B.1.429). Той може да увеличи свързващата сила на шиповите протеини с ACE2 рецепторите върху човешките клетки, което го прави по-преносим. L452R може също потенциално да подобри вирусната репликация.
Заедно, E484Q и L452R са по-инфекциозни и могат да избягват антителата.
Къде е намерен B.1.617?
Има ограничени данни. За първи път беше съобщено от Махаращра. През януари бяха секвенирани 19 проби от различни области, а B.1.617 беше намерен в четири. През февруари бяха секвенирани 234 проби от 18 области, а 151 проби - от най-малко 16 области - имаха този вариант. А през март цели 65 от 94 проби го имаха.
Досега областите Amravati, Nagpur, Akola, Wardha, Pune, Thane, Aurangabad и Chandrapur са представили убедителни доказателства за наличието на B.1.617. По-малко проби са секвенирани в други области, а вариантът е открит в някои. Предстои секвениране за още проби.
ПРИСЪЕДИНИ СЕ СЕГА :Телеграмният канал Express Explained
Този вариант по-вирулентен ли е?
До момента няма доказателства. Повечето пациенти могат да се справят с домашна изолация, въпреки че клиничният опит трябва да се комбинира с данни за секвениране на генома, за да се генерират научни доказателства. Клиничните анекдоти от лекари предполагат, че вариантът се разпространява по-бързо, по-заразен е, може да зарази цели семейства, но е по-малко вирулентен и не причинява драстично повече хоспитализации.
Повечето пациенти са асимптоматични и това е добра индикация. Но в абсолютни цифри толкова много случаи натовариха здравната инфраструктура, каза д-р Шашанк Джоши, експерт от оперативната група за Covid в Махаращра.
Колко се е разпространил?
Д-р Суджит Сингх, директор на Националния център за контрол на заболяванията (NCDC), посочи, че много малко проби от Махаращра са секвенирани досега и е твърде рано да се правят окончателни заключения за това колко широко разпространен е двойният мутант. Въпреки това централното правителство съобщи през март, че 15-20 процента проби в Махаращра имат този вариант; въз основа на последните данни за последователността знаем, че този брой вече е над 60 процента.
Клиницисти и областни администратори в Махаращра съобщават, че за разлика от първата вълна, цели семейства се заразяват при втората вълна. Това може да означава или че мерките за физическо дистанциране и изолация са неадекватни в домакинството, или че вирусът е станал по-предаваем.
Възможно ли е B.1.617 да стимулира продължаващия скок в случаите на Covid-19?
Д-р Гангандип Канг, професор по микробиология в Christian Medical College, Vellore, каза, че 60,9% проби, носещи този вариант, най-вероятно показват връзка между мутацията и нарастването - но за точен отговор поне 1% от пробите от Covid-19 трябва да се подреждат всяка седмица. Тъй като Индия в момента тества над 1000 случая на ден и това би означавало приблизително 1000 геномни последователности всеки ден.
Трябва също така да разгледаме колко хора е в състояние да зарази човек и прага на RT-PCR цикъла. Трябва да направим проследяване на живо. Данните от януари нямат малка стойност през април, каза д-р Канг.
Д-р Гаутам Менон, професор в университета Ашока, Сонепат, и в Института по математически науки, Ченай, каза: Това, което имаме, е предполагащо, но се нуждаем от повече данни за секвениране на генома, за да разберем кой вариант води до броя на новите инфекции в различни държави... За да предположим, че нарастването на случаите се дължи на този двоен мутантен вариант, трябва да имаме повече времеви точки. Например, ако можем да кажем, че открихме 30 процента от този вариант в проби на 30 март и след това 40 процента в проби на 14 април, това би означавало, че новият вариант доминира в разпространението на болестта.
Д-р Менон също подчерта необходимостта от по-голяма прозрачност на данните. Възможно е, макар и все по-малко вероятно, случаите да са свързани и с предишния щам, каза той. Освен ако не знаем до каква степен увеличението може да се дължи на новия вариант, няма да можем да определим окончателно дали релаксациите в поведението, подходящо за Covid с по-стария щам, са довели до увеличенията или дали повишената инфекциозност на новия вариант е причина.
Проф. Винод Скария, главен учен, CSIR -IGIB, се съгласи, че не можем категорично да кажем, че тези варианти предизвикват скока във втората вълна. Въпреки това, доказателствата сочат, че поне в някои щати, линията B.1.1617 е преобладаваща и може да допринесе за увеличаването на случаите, каза той. Тази линия се определя от 15 генетични варианта, включително шест варианта на шиповия протеин. Два от тях (E484Q и L452R) участват в имунното бягство, както и в повишената инфекциозност, каза проф. Скария.
Може ли вариантът да избегне ваксините?
Отново данните са ограничени. Някои хора наистина са били заразени след първата доза, но няма данни дали техните проби са били изпратени за секвениране на генома.
Знаем, че южноафриканският вариант е по-способен да избегне имунния отговор. Знаем, че британският вариант е най-преносим. Но засега не знаем нищо за B.1.617, защото не събираме данни, за да правим заключения, каза д-р Канг.
Д-р Менон подчерта, че докато ваксините не се очаква да предотвратят инфекция, те със сигурност предотвратяват тежки заболявания и смърт. Очакваме това да остане вярно дори и с новия вариант. Единственото средно- и дългосрочно решение за справяне с Covid-19 е хората да бъдат ваксинирани.
Споделете С Приятелите Си:
