Обяснено: Колко бързо се разпространява новият щам на коронавирус? Ще повлияе ли на ваксинацията?

Нов щам на коронавирус в Обединеното кралство: Индия и няколко други страни спряха полетите до и от Обединеното кралство. Какви мутации доведоха до варианта на коронавирус, който предизвика безпокойство? Колко бързо се е разпространило? И ще повлияе ли това на ваксинацията?

Полетите от Великобритания са отменени на летище Cointrin, в Женева, Швейцария, 21 декември 2020 г. (Ройтерс Снимка: Denis Balibouse)

В понеделник Индия спря всички полети от и за Обединеното кралство до 31 декември, на фона на опасения относно a нов вариант на SARS-CoV-2, който се разпространява и нараства бързо там. Няколко други страни също спряха полетите в Обединеното кралство и наложиха ограничения за пътуване.

Какви са тези опасения, водещи до ограничения за пътуване?

Миналата седмица беше разкрито, че новият вариант на SARS-CoV-2 е причината за бързото нарастване на случаите на Covid-19 в Южна и Източна Англия. Нарича се VUI (вариант под разследване) 202012/01 или линията B.1.1.7.

През последните няколко дни, благодарение на нашата геномна способност от световна класа, ние идентифицирахме нов вариант на коронавируса, който може да бъде свързан с по-бързото разпространение в Южна Англия, каза министърът на здравеопазването на Обединеното кралство Мат Ханкок пред Камарата на общините на 14 декември. Британските власти вече са уведомили Световната здравна организация за варианта.

Public Health England (PHE) обяви, че към 13 декември са идентифицирани 1108 случая с този вариант, предимно в Южна и Източна Англия. PHE работи с партньори за разследване и планира да сподели своите констатации през следващите 2 седмици, се казва в него.

Какъв е вариантът?

Вариантът е идентифициран при геномно наблюдение от COVID-19 Genomics UK (COG-UK), консорциум, който анализира данни за секвениране на генома от Обединеното кралство. COG-UK е най-големият участник в глобалната база данни Covid-19 GISAID.

Вариантът е резултат от множество мутации в шиповия протеин на новия коронавирус SARS-CoV-2, както и мутации в други геномни региони на РНК вируса. Предварителният анализ показва, че е по-преносим от предишните циркулиращи варианти. COG-UK идентифицира една от тези мутации като N501Y, в зона на шиповия протеин, който се свързва с ключов протеин в човешката клетка, ACE2 рецептора. Това беше индикация, че промените теоретично могат да доведат до това вирусът да стане по-инфекциозен. Полагат се усилия да се потвърди дали някоя от тези мутации допринася за повишено предаване, каза консорциумът.

Какво знаем досега за предаването и тежестта на заболяването?

В неделя PHE каза, че данните от секвениране на целия геном, епидемиология и моделиране предполагат, че новият вариант се предава по-лесно от другите щамове.

Въпреки това, той също така подчерта, че няма доказателства, че вариантът е по-вероятно да причини тежко заболяване или смърт. ... Но ние продължаваме разследванията, за да разберем това по-добре, се казва в него. Той каза, че смъртността е изоставащ индикатор и ще наблюдава непрекъснато това през следващите седмици.

PHE заяви, че все още не знае механизма за това увеличение на предаването. Знаем, че мутациите в шиповия протеин, частта от вируса, която го прави заразен, могат да променят начина, по който вирусът взаимодейства с човешките клетки, се казва в него.

В него се казва, че доказателствата показват, че степента на заразяване в географски райони, където този конкретен щам циркулира, са се увеличили по-бързо от очакваното, а доказателствата от моделирането показват, че този вариант има по-висока скорост на предаване от другите варианти в текущата циркулация.

Нов щам на коронавирус в Обединеното кралство: Полицейски служител насочва трафика на входа на затворения фериботен терминал в Дувър, Англия, в понеделник, след като пристанището на Дувър беше затворено. (AP снимка)

Колко притеснение е по-високата предавателна способност?

На 18 декември Консултативната група за заплахи от нови и нововъзникващи респираторни вируси (NERVTAG), която съветва правителството на Обединеното кралство относно заплахата от новите и нововъзникващите респираторни вируси, заяви, че новият вариант може потенциално да увеличи репродуктивния брой на заболяването с до 0,93 . Той каза, че има умерена увереност, че новият вариант демонстрира значително увеличение на предавателната способност в сравнение с други варианти.

Експертният орган обаче заключи, че в момента няма достатъчно данни, за да се направи каквото и да е заключение относно основния механизъм на повишена трансмисивност, възрастовото разпределение на случаите и тежестта на заболяването. В него се казва, че са идентифицирани 4 смъртни случая при около 1000 случая, но е необходима допълнителна работа, за да се сравни този процент на смъртност със сравними набори от данни.

Местоположението на мутациите в рецептор-свързващия домен на шиповия гликопротеин повишава възможността този вариант да е антигенно различен от предишните варианти. Четири вероятни повторни инфекции са идентифицирани сред 915 субекта с този вариант, но е необходима допълнителна работа, за да се сравни този процент на повторно заразяване със сравними набори от данни, се казва в него.

В неделя кратка информация за оценка на заплахата, публикувана от Европейския център за превенция и контрол на заболяванията, казва, че филогенетичният анализ разкрива, че клъстерът се различава с 29 нуклеотидни замествания от оригиналния щам Ухан. Три последователности от Дания и една от Австралия, от проби, събрани през ноември 2020 г., се групират с варианта на Обединеното кралство, което най-вероятно показва, че е настъпило международно разпространение, въпреки че степента остава неизвестна, се казва в него.

Нов щам на коронавирус в Обединеното кралство: Пристанището на Дувър се затваря, тъй като страните от ЕС налагат забрана за пътуване от Обединеното кралство. (Снимка на Ройтерс)

Но вирусът не е ли мутирал преди?

Всеки път, когато вирусът се репликира и циркулира в човешката популация, мутациите се появяват естествено, със скорост от около една до две мутации на месец в глобалната филогенеза.

Всъщност за SARS-CoV-2, COG-UK казва, че в момента има около 4000 мутации в шиповия протеин. Вариантът D614G по-рано беше доминиращ щам, защото се разпространяваше много лесно. Друг щам, който произхожда от испански земеделски работници, 20A. EU1, се разпространява бързо в цяла Европа през лятото.

Трудно е да се предвиди дали дадена мутация е важна, когато се появи за първи път, на фона на непрекъснатата поява на нови мутации. Разбирането на тяхното значение може да бъде възможно въз основа на експериментална работа, която показва връзка между мутацията и фината промяна в биологията на вируса. Въпреки това, ще отнеме значително време и усилия, за да се тества ефектът от много хиляди комбинации от мутации, каза COG-UK.

Ще повлияе ли това на разработването и отговора на ваксината?

В неделя властите на Обединеното кралство заявиха, че по-нататъшна лабораторна работа се предприема като приоритет, за да се разбере това. Понастоящем няма доказателства, които да предполагат, че ваксината Pfizer няма да защити хората срещу новия щам, каза PHE.

Споделете С Приятелите Си: